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Make your own R package! - 10. 설명서(Vignette)와 마크다운(markdown)에 대하여

Make your own R package! - 10. 설명서(Vignette)와 마크다운(markdown)에 대하여 Vignette이란 단어를 R 패키지를 만들며 처음 접했을 때, 생소한 단어라서 당황했던 기억이 있다. Vignette의 뜻은 책의 타이틀 페이지나 요약본이라는 뜻인데, 프랑스에서 전해진 단어라서 그런지 우리가 생각하는 비그넷이 아닌 “빈옛(트)”으로 g를 묵음처리해서 발음한다. 다음의 링크를 타고 한번 들어보도록 하자.(http://aha-dic.com/View.asp?Word=vignette) 오늘은 패키지의 설명서라고 할 수 있는 Vignette을 만드는 방법에 대하여 알아보도록 하자. 이제까지 포스팅을 하면서 사용한 함수들을 필자의 패키지에 넣어놓았는데, 이제 필자의 패키지에도 들..
R Programming/Rpackage 2017. 8. 7. 12:23

Make your own R package! - 9. C 함수 R 패키지에 넣기 native routines 등록에 대하여

Make your own R package! - 9. C언어와 연결된 함수 R 패키지에 넣기 이제까지 우리는 R와 C를 연결하는 방법에 대하여 알아보았다. 오늘은 이렇게 작성한 함수를 우리가 만든 패키지에 넣는 방법에 대하여 알아보도록 하자. 사용할 파일 준비하기 R 파일 준비하기 우리가 패키지에 넣을 함수는 파레토 분포의 확률밀도함수를 계산하는 dpareto 함수이다. 우리가 정의할 dpareto 함수는 R 사용자로부터 입력값을 넘겨 받아 .C 함수를 사용하여 전달받은 입력값들을 C로 짜여진 함수로 넘겨주게 된다. 필자의 경우 paretodens 라는 C함수로 넘겨줄 예정이다. 이렇게 R과 C사이의 교량 역할을 하는 함수를 보통 wrapper 함수라고 하는데, 이유는 뜯어보면 C에서 작동하는 함수이지만..
R Programming/Rpackage 2017. 8. 6. 14:59

Make your own R package! - 8. C언어에서 recycling 구현과 functional programming

이전 포스팅에서 우리는 R함수와 C언어 짜여진 함수를 연결하는 방법에 대하여 알아보았다. 이전 포스팅에서는 R 함수를 이용하여 입력값의 길이가 다른 경우 lengthout 옵션을 이용하여 같은 길이의 벡터로 바꿔주었는데, 이 부분을 이번에는 C에서 구현해보도록 하자. C 함수에서의 recyling 구현 C 함수에서 R에서의 recycling을 구현하기 위해서는 % 연산자를 잘 사용하면 된다. 필자가 정의한 함수의 코드를 살펴보도록 하자. 아래의 코드에서 입력값들은 x, alpha, x_m 벡터와 각각의 길이를 담고있는 input_len 벡터, 그리고 가장 긴 벡터의 길이 max_len, log를 처리하기 위한 indicator, 결과를 전달받을 density 벡터를 의미한다. 가장 핵심이 되는 부분은 f..
R Programming/Rpackage 2017. 8. 5. 19:00

Make your own R package! - 7. R과 C 언어 연결하기 / R CMD SHLIB 명령어 사용 및 dyn.load 함수

Make your own R package! - 7. R과 C 언어 연결하기 오늘의 주제는 R와 C 언어를 연결하기 위한 준비단계로 이전 포스팅에서 짰던 dpareto함수를 C언어로 짜는 것을 알아보도록 하겠다. R을 주로 포스팅하는 필자가 C언어에 대하여 포스팅하는 이유는 C언어를 다룰수 있으면 R이 제일 취약한 부분인 루프(loop) 부분을 C로 넘겨서 계산을 할 수 있도록 연결해줄 수 있기 때문이다. C 언어로 함수 정의하기 이전 포스팅에서 다루었던 파레토 분포의 확률밀도함수 dpareto를 C언어를 사용하여 만들어 보도록 하자. 먼저 가장 기본이 되는 변수 하나씩 받을 수 있는 함수를 paretodens라는 이름으로 다음과 같이 정의할 수 있다. C의 경우 함수의 앞에 함수의 결과값이 어떠한 형식..
R Programming/Rpackage 2017. 8. 3. 18:25

Make your own R package! - 6. R 함수 벡터화(Vectorized function)에 대하여

Make your own R package! - 6. 함수 벡터화(Vectorized function)에 대하여 오늘의 주제는 함수를 정의하는 방법에 대한 내용이다. 패키지에 함수를 정의해서 사용하는 방법은 사실 이전 포스팅에서 많이 다루었다. 하지만 만약 훗날 다른 사람들을 위하여 함수를 정의하고 배포할 경우 고려해야하는 사항들을 한번 알아보도록 하자. 이 포스팅은 필자가 수강한 학교 수업의 숙제에서 따온 내용이다. Pareto분포의 확률밀도함수 dpareto 정의하기 R은 여러 통계 분포에 관한 함수를 제공하고 있다. 예를 들어 정규분포의 경우, 확률밀도함수는 dnorm, 누적분포함수는 pnorm 등 앞의 분포의 이름 앞에 제공하는 함수의 성질을 간략한 약자를 사용하여 나타내고있다. 오늘 우리가 만들..
R Programming/Rpackage 2017. 8. 2. 02:05